Qu'est-ce que le Pcoa ?
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Vidéo: Qu'est-ce que le Pcoa ?

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Vidéo: StatQuest: MDS and PCoA 2024, Novembre
Anonim

PCoA est une méthode de mise à l'échelle ou d'ordination qui commence par une matrice de similitudes ou de dissemblances entre un ensemble d'individus et vise à produire un tracé graphique de faible dimension des données de telle sorte que les distances entre les points du tracé soient proches des dissemblances d'origine.

De même, qu'est-ce que l'analyse PCoA ?

Coordonnées principales Une analyse ( PCoA , = Mise à l'échelle multidimensionnelle, MDS) est une méthode pour explorer et visualiser les similitudes ou les dissemblances des données. Il commence par une matrice de similarité ou de dissimilarité (= matrice de distance) et attribue à chaque élément un emplacement dans un espace de faible dimension, par ex. comme un graphique 3D.

Sachez également, qu'est-ce qu'un complot d'ordination? Une cénocline est une représentation graphique de toutes les fonctions de réponse des espèces dans une communauté tracée le long d'un seul gradient environnemental. Compte tenu du grand nombre d'espèces et du bruit élevé dans la plupart des études, les cénoclines ne sont généralement affichées que sous une forme très simplifiée.

Deuxièmement, quelle est la différence entre PCA et PCoA ?

Tandis que APC est basé sur les distances euclidiennes, PCoA peut gérer des matrices de (dis) similitudes calculées à partir de variables quantitatives, semi-quantitatives, qualitatives et mixtes. Comme toujours, le choix de la mesure de (dis)similarité est critique et doit être adapté aux données en question.

Qu'est-ce que la mise à l'échelle multidimensionnelle non métrique ?

Non - mise à l'échelle multidimensionnelle métrique (NMDS) est une approche d'analyse de gradient indirect qui produit une ordination basée sur une matrice de distance ou de dissimilarité. Tout coefficient de dissemblance ou mesure de distance peut être utilisé pour construire la matrice de distance utilisée comme entrée. Le NMDS est une approche basée sur le classement.

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