Vidéo: Quelle est la différence entre l'ARNr 16s et l'ARNr 18s ?
2024 Auteur: Miles Stephen | [email protected]. Dernière modifié: 2023-12-15 23:36
Le principal différence entre effectuer des analyses avec ARNr 18S données génétiques au lieu de ARNr 16S les données génétiques (ou données ITS) sont la base de données de référence utilisée pour la sélection OTU, les affectations taxonomiques et la construction d'alignement basée sur des modèles, car elles doivent contenir des séquences eucaryotes.
Compte tenu de cela, pourquoi le gène de l'ARNr 16s est-il utilisé pour l'identification ?
Les Gène de l'ARN ribosomique 16S code pour le composant ARN de la sous-unité 30S du ribosome bactérien. En raison de la complexité de l'hybridation ADN-ADN, Gène de l'ARNr 16S le séquençage est utilisé comme un outil pour identifier bactéries au niveau de l'espèce et aident à différencier les espèces bactériennes étroitement apparentées [8].
De plus, les eucaryotes ont-ils un ARNr 16s ? Les ARNr 16S gène est présent dans toutes les bactéries, et une forme apparentée se produit dans toutes les cellules, y compris celles de eucaryotes.
La question est également: qu'est-ce que l'ARNr 18s et 28s ?
Les 28S / ARN ribosomique 18S est fréquemment utilisé pour évaluer la qualité de l'ARN total purifié à partir d'un échantillon donné. Chez l'homme, ARNr 28S a ~5070 nucléotides, et 18S a 1869 nucléotides, ce qui donne un 28S / 18S rapport de ~2,7. Un haut 28S / 18S rapport est une indication que l'ARN purifié est intact et ne s'est pas dégradé.
Qu'est-ce que le séquençage de l'ARNr 16s ?
ARNr 16S gène séquence l'analyse est une méthode standard de taxonomie et d'identification bactérienne, et est basée sur la détection de séquence différences (polymorphismes) dans les régions hypervariables de la ARNr 16S gène présent dans toutes les bactéries.
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